北京大学深圳研究生院环境与能源学院余珂课题组,基于北京大学深圳研究生院智慧科学计划(AI for Sciences),招收具有生物信息学方法学构建经验、微生物代谢机理与合成生物学研究经验的博士后研究人员,参与特殊代谢反应相关基因元件识别、代谢通路设计及新型微生物功能细胞构建等课题。现面向海内外招聘特别研究助理(博士后)1—2名,工作地点深圳。
余珂课题组简介
余珂,博士,北京大学深圳研究生院长聘副教授、研究员,同时担任北京大学环境科学与工程、计算机应用技术双学科博士生导师。现任Microbiome期刊资深编辑(Senior Editor)及iMeta等期刊编委。2025年和2026年连续入选斯坦福大学全球前2%顶尖科学家“年度科学影响力排行榜”(微生物学方向)。研究方向聚焦于构建从环境微生物“暗物质”到可计算知识的高通量转化管道。围绕高盐、高碱、低温等特殊生境,课题组自主研发分子生物学技术和智能分析方法,系统开展微生物基因组解析与功能注释。形成的结构化组学数据,既为领域专用人工智能模型提供训练数据,也支撑面向微生物组的智能算法与预测模型研发。目前,该技术管道已在三个层面实现初步集成:
1. 功能基因组学层面:开发融合深度学习的高灵敏度基因组识别方法及配套算法,捕获并解析常规流程易遗漏的低丰度功能类群及其基因组;结合蛋白质与基因组语言模型,挖掘传统同源比对难以发现的新型酶、远缘功能基因、代谢基因簇及环境适应元件。
2. 代谢反应网络层面:以最小生化反应单元为基本模块,构建贯通基因、酶、底物、产物与反应的知识图谱,融合知识图谱推理与基于向量数据库的多组学证据语义检索,构建多智能体协同推理框架,实现新型代谢途径的自动发现、可行性评估与实验验证。
3. 群落互作调控层面:基于宏基因组解析的群落结构,融合功能基因、代谢物交换与环境因子,构建群落互作的可计算世界模型,预测群落互作、状态演化及干预响应。
岗位职责
(1)熟悉各种生化反应过程,整理反应知识图谱,并结合AI技术,开发新算法或流程,高通量、高灵敏地挖掘组学数据中的天然活性产物合成及污染物降解新基因簇或新通路,并配合课题组成员实施关键验证实验;
(2)协助合作导师,进行相关项目的撰写及申请;协助指导相关方向研究生。
任职条件
(1)具有生物信息学、分子生物学、生物化学、微生物学或信息工程等相关专业博士学位(不限国籍);相关交叉学科背景者可联系确认报名资格。
(2)已经获得或即将获得博士学位,年龄不超过35周岁(含);
(3)以第一或通讯作者在本专业主流学术期刊上发表过高水平研究论文,有以下的人员优先考虑:
a) 熟悉氨基酸、嘌呤、碳水化合物、萜类等各种生化代谢过程;
b) 具有微生物代谢机理或合成生物学相关研究经验者;
c) 具备编程(AI编程经验最优)能力者;
(4)具有较强的中英文写作与交流的能力;
(5)热爱科学研究,实验能力强,具有积极进取的工作精神与团队合作精神,责任感强;
(6)身心健康,具备良好的沟通能力。
工作地点及其他
依托于北京大学深圳研究生院环境与能源学院,应聘成功者将于深圳开展工作。
岗位待遇
(一)基础待遇
工资及福利待遇按北京大学深圳研究生院和国家有关规定执行。基础年薪12万,深圳市博士后补贴18万元每年,总计约30万元的税前收入。年度考核优秀者,项目组每年提供额外的激励性措施。
(二)其它福利待遇:
(1)在站期间,符合条件的可竞争性申报国家“博新计划”(国家给予每人两年63万元的资助,其中40万为日常经费,20万为科学基金,3万为国际交流经费)、博士后国际交流计划引进项目(40万/2年)、广东省青年优秀科研人才国际培养计划(40万/2年),以上项目与广东省日常经费及深圳市生活补贴不可兼得;
(2)在站期间,符合世界前200高校排名的海外博士后可竞争性申报广东省海外博士后人才支持项目(在站60万/2年,出站留粤住房补贴40万,总额100万),以上项目与广东省日常经费及深圳市生活补贴不可兼得;
(3)出站后留深签约3年工作劳动合同,可申请深圳市博士后出站留(来)深科研资助36万(每年12万共计3年)。
应聘方式
1. 特别研究助理(博士后)岗位长期招聘,自发布招聘通知之日起至招满为止,符合上述条件的应聘者请将应聘材料发送至 yuke.sz@pku.edu.cn,邮件主题请注明“应聘余珂组博士后+姓名+学校/现单位”,并附个人简历。
2. 初选合格者电话或E-mail通知本人参加面试;
3. 参加面试者需提供:1)学历、学位证书及复印件;2)专家推荐信和其它可证明本人能力及水平的相关资料;
4. 通过面试者到指定医院进行体检,体检合格者将被录用。